Hönnun býflugnabúa byggir fyrst og fremst á hegðunarvenjum býflugna og hagnýtum kröfum um stjórnun býflugnaræktar; með því að líkja eftir náttúrulegu umhverfi býflugnabúa veitir hönnunin öruggt og stöðugt búsvæði. Innra rými, byggingarmál og hönnun íhluta verða að vera í samræmi við þarfir býflugna fyrir hreiður, æxlun, hunangsgeymslu og nýlendustarfsemi, sem tryggir að nýlendan viðheldur heilbrigðum þroska.
Hönnun býflugnabúa setur staðbundna skilvirkni og stöðlun bygginga í forgang. Innra rýmið verður að vera í viðeigandi stærð til að koma í veg fyrir offyllingu-sem á sér stað þegar plássið er of takmarkað-samhliða því að forðast of mikið rúmmál sem gæti komið í veg fyrir hitahald. Íhlutir eins og greiðugrind og grunnplötur eru hannaðar með stöðluðum stærðum, sem auðveldar skoðun, skipti og stjórnun og eykur þannig heildarhagkvæmni býflugnaræktar.
Býflugnabú verða einnig að bjóða upp á skilvirka umhverfisstjórnunarmöguleika. Með vali á efnum, loftræstimannvirkjum og varmaeinangrunarhönnun hjálpar býflugnabúið að stjórna innra hitastigi og raka og viðhalda stöðugu lífsumhverfi fyrir býflugurnar á mismunandi árstíðum. Til dæmis veita viðarefni náttúrulega hitaeinangrun og rakastjórnun, á meðan loftræstiopar bæta loftflæði, draga úr vandamálum sem tengjast raka og kæfandi hita.
Að lokum leggur býflugnabúhönnun áherslu á auðvelda notkun og endingu. Vel-hönnuð uppbygging gerir býflugnaræktendum kleift að opna býflugnabúið auðveldlega fyrir skoðanir, hunangsuppskeru og reglubundið viðhald. Það verður einnig að vera viðnám gegn raka, meindýrum og rigningu, sem tryggir hæfi til langtímanotkunar utandyra. Með vísindalegum hönnunarreglum verndar býflugnabúið nýlenduna en eykur um leið stjórnunarskilvirkni og framleiðni.
